Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Riok3Q9DBU3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Riok3Q9DBU3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Riok3Q9DBU3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Riok3Q9DBU3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Riok3Q9DBU3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Riok3Q9DBU3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Riok3Q9DBU3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Riok3Q9DBU3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Riok3Q9DBU3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Riok3Q9DBU3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Riok3Q9DBU3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Riok3Q9DBU3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Riok3Q9DBU3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Riok3Q9DBU3 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Riok3Q9DBU3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Riok3Q9DBU3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Riok3Q9DBU3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Riok3Q9DBU3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Riok3Q9DBU3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Riok3Q9DBU3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Riok3Q9DBU3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Riok3Q9DBU3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Riok3Q9DBU3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Riok3Q9DBU3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Riok3Q9DBU3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Riok3Q9DBU3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Riok3Q9DBU3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Riok3Q9DBU3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Riok3Q9DBU3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Riok3Q9DBU3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Riok3Q9DBU3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Riok3Q9DBU3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Riok3Q9DBU3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Riok3Q9DBU3 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Riok3Q9DBU3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Riok3Q9DBU3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Riok3Q9DBU3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Riok3Q9DBU3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Riok3Q9DBU3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Riok3Q9DBU3 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Riok3Q9DBU3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Riok3Q9DBU3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Riok3Q9DBU3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Riok3Q9DBU3 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Riok3Q9DBU3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Riok3Q9DBU3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms