Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc105Q9D4K7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc105Q9D4K7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc105Q9D4K7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc105Q9D4K7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc105Q9D4K7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc105Q9D4K7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc105Q9D4K7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc105Q9D4K7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc105Q9D4K7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc105Q9D4K7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc105Q9D4K7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc105Q9D4K7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc105Q9D4K7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc105Q9D4K7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc105Q9D4K7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc105Q9D4K7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc105Q9D4K7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc105Q9D4K7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc105Q9D4K7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc105Q9D4K7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc105Q9D4K7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc105Q9D4K7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc105Q9D4K7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc105Q9D4K7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc105Q9D4K7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc105Q9D4K7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc105Q9D4K7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc105Q9D4K7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc105Q9D4K7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc105Q9D4K7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc105Q9D4K7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc105Q9D4K7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc105Q9D4K7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc105Q9D4K7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc105Q9D4K7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc105Q9D4K7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc105Q9D4K7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc105Q9D4K7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc105Q9D4K7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc105Q9D4K7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc105Q9D4K7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc105Q9D4K7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc105Q9D4K7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc105Q9D4K7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc105Q9D4K7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc105Q9D4K7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc105Q9D4K7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc105Q9D4K7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc105Q9D4K7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc105Q9D4K7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc105Q9D4K7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc105Q9D4K7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc105Q9D4K7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc105Q9D4K7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc105Q9D4K7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc105Q9D4K7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc105Q9D4K7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc105Q9D4K7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc105Q9D4K7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc105Q9D4K7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc105Q9D4K7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms