Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpn3Q9D3W4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpn3Q9D3W4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpn3Q9D3W4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpn3Q9D3W4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpn3Q9D3W4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpn3Q9D3W4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpn3Q9D3W4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpn3Q9D3W4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpn3Q9D3W4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpn3Q9D3W4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpn3Q9D3W4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpn3Q9D3W4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpn3Q9D3W4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpn3Q9D3W4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpn3Q9D3W4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpn3Q9D3W4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpn3Q9D3W4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gpn3Q9D3W4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gpn3Q9D3W4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpn3Q9D3W4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms