Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph14Q9D3W1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rsph14Q9D3W1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rsph14Q9D3W1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms