Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3G5

Stx11, Syntaxin-11, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx11Q9D3G5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx11Q9D3G5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx11Q9D3G5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx11Q9D3G5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx11Q9D3G5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx11Q9D3G5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx11Q9D3G5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx11Q9D3G5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx11Q9D3G5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx11Q9D3G5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx11Q9D3G5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx11Q9D3G5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx11Q9D3G5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx11Q9D3G5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx11Q9D3G5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx11Q9D3G5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx11Q9D3G5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx11Q9D3G5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx11Q9D3G5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx11Q9D3G5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx11Q9D3G5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx11Q9D3G5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx11Q9D3G5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stx11Q9D3G5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx11Q9D3G5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx11Q9D3G5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx11Q9D3G5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx11Q9D3G5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx11Q9D3G5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx11Q9D3G5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx11Q9D3G5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx11Q9D3G5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx11Q9D3G5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx11Q9D3G5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx11Q9D3G5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx11Q9D3G5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx11Q9D3G5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx11Q9D3G5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx11Q9D3G5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx11Q9D3G5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx11Q9D3G5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx11Q9D3G5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx11Q9D3G5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx11Q9D3G5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx11Q9D3G5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx11Q9D3G5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx11Q9D3G5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx11Q9D3G5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx11Q9D3G5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx11Q9D3G5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx11Q9D3G5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx11Q9D3G5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx11Q9D3G5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx11Q9D3G5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx11Q9D3G5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx11Q9D3G5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx11Q9D3G5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx11Q9D3G5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx11Q9D3G5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx11Q9D3G5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx11Q9D3G5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx11Q9D3G5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx11Q9D3G5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx11Q9D3G5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx11Q9D3G5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx11Q9D3G5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx11Q9D3G5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx11Q9D3G5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx11Q9D3G5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms