Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3B1

Hacd2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd2Q9D3B1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hacd2Q9D3B1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hacd2Q9D3B1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hacd2Q9D3B1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hacd2Q9D3B1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hacd2Q9D3B1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hacd2Q9D3B1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hacd2Q9D3B1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hacd2Q9D3B1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hacd2Q9D3B1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hacd2Q9D3B1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hacd2Q9D3B1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hacd2Q9D3B1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hacd2Q9D3B1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hacd2Q9D3B1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hacd2Q9D3B1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hacd2Q9D3B1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hacd2Q9D3B1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hacd2Q9D3B1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hacd2Q9D3B1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms