Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snrnp35Q9D384 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snrnp35Q9D384 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snrnp35Q9D384 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snrnp35Q9D384 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snrnp35Q9D384 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snrnp35Q9D384 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snrnp35Q9D384 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snrnp35Q9D384 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snrnp35Q9D384 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snrnp35Q9D384 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snrnp35Q9D384 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snrnp35Q9D384 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snrnp35Q9D384 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snrnp35Q9D384 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snrnp35Q9D384 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snrnp35Q9D384 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snrnp35Q9D384 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snrnp35Q9D384 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snrnp35Q9D384 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snrnp35Q9D384 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snrnp35Q9D384 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snrnp35Q9D384 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snrnp35Q9D384 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snrnp35Q9D384 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snrnp35Q9D384 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snrnp35Q9D384 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snrnp35Q9D384 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snrnp35Q9D384 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snrnp35Q9D384 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snrnp35Q9D384 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snrnp35Q9D384 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snrnp35Q9D384 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snrnp35Q9D384 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snrnp35Q9D384 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Snrnp35Q9D384 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Snrnp35Q9D384 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snrnp35Q9D384 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snrnp35Q9D384 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snrnp35Q9D384 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snrnp35Q9D384 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Snrnp35Q9D384 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snrnp35Q9D384 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Snrnp35Q9D384 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snrnp35Q9D384 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snrnp35Q9D384 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snrnp35Q9D384 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snrnp35Q9D384 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snrnp35Q9D384 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms