Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rasgef1cQ9D300 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rasgef1cQ9D300 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rasgef1cQ9D300 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rasgef1cQ9D300 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rasgef1cQ9D300 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rasgef1cQ9D300 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rasgef1cQ9D300 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rasgef1cQ9D300 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rasgef1cQ9D300 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rasgef1cQ9D300 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rasgef1cQ9D300 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rasgef1cQ9D300 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rasgef1cQ9D300 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rasgef1cQ9D300 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rasgef1cQ9D300 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rasgef1cQ9D300 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rasgef1cQ9D300 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rasgef1cQ9D300 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rasgef1cQ9D300 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rasgef1cQ9D300 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rasgef1cQ9D300 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rasgef1cQ9D300 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rasgef1cQ9D300 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasgef1cQ9D300 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasgef1cQ9D300 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasgef1cQ9D300 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasgef1cQ9D300 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasgef1cQ9D300 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rasgef1cQ9D300 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rasgef1cQ9D300 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rasgef1cQ9D300 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rasgef1cQ9D300 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rasgef1cQ9D300 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rasgef1cQ9D300 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rasgef1cQ9D300 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasgef1cQ9D300 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasgef1cQ9D300 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasgef1cQ9D300 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasgef1cQ9D300 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasgef1cQ9D300 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasgef1cQ9D300 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rasgef1cQ9D300 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rasgef1cQ9D300 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rasgef1cQ9D300 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rasgef1cQ9D300 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rasgef1cQ9D300 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rasgef1cQ9D300 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rasgef1cQ9D300 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rasgef1cQ9D300 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rasgef1cQ9D300 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rasgef1cQ9D300 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rasgef1cQ9D300 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rasgef1cQ9D300 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rasgef1cQ9D300 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rasgef1cQ9D300 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rasgef1cQ9D300 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rasgef1cQ9D300 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rasgef1cQ9D300 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rasgef1cQ9D300 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rasgef1cQ9D300 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rasgef1cQ9D300 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rasgef1cQ9D300 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rasgef1cQ9D300 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rasgef1cQ9D300 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rasgef1cQ9D300 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rasgef1cQ9D300 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rasgef1cQ9D300 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rasgef1cQ9D300 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rasgef1cQ9D300 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rasgef1cQ9D300 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rasgef1cQ9D300 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rasgef1cQ9D300 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rasgef1cQ9D300 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rasgef1cQ9D300 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rasgef1cQ9D300 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rasgef1cQ9D300 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rasgef1cQ9D300 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rasgef1cQ9D300 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rasgef1cQ9D300 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rasgef1cQ9D300 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rasgef1cQ9D300 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rasgef1cQ9D300 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rasgef1cQ9D300 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rasgef1cQ9D300 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rasgef1cQ9D300 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rasgef1cQ9D300 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rasgef1cQ9D300 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rasgef1cQ9D300 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rasgef1cQ9D300 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rasgef1cQ9D300 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rasgef1cQ9D300 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rasgef1cQ9D300 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rasgef1cQ9D300 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rasgef1cQ9D300 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rasgef1cQ9D300 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rasgef1cQ9D300 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rasgef1cQ9D300 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rasgef1cQ9D300 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rasgef1cQ9D300 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms