Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps33aQ9D2N9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps33aQ9D2N9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps33aQ9D2N9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps33aQ9D2N9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps33aQ9D2N9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps33aQ9D2N9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps33aQ9D2N9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps33aQ9D2N9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps33aQ9D2N9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps33aQ9D2N9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps33aQ9D2N9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps33aQ9D2N9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps33aQ9D2N9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps33aQ9D2N9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps33aQ9D2N9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps33aQ9D2N9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps33aQ9D2N9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps33aQ9D2N9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vps33aQ9D2N9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps33aQ9D2N9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps33aQ9D2N9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps33aQ9D2N9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps33aQ9D2N9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps33aQ9D2N9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps33aQ9D2N9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps33aQ9D2N9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps33aQ9D2N9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps33aQ9D2N9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps33aQ9D2N9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps33aQ9D2N9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps33aQ9D2N9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps33aQ9D2N9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps33aQ9D2N9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps33aQ9D2N9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps33aQ9D2N9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps33aQ9D2N9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps33aQ9D2N9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps33aQ9D2N9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps33aQ9D2N9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps33aQ9D2N9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps33aQ9D2N9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps33aQ9D2N9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps33aQ9D2N9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps33aQ9D2N9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps33aQ9D2N9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.5 ms