Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krtap5-3Q9D226 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krtap5-3Q9D226 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krtap5-3Q9D226 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Krtap5-3Q9D226 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms