Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1M4

Eef1e1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eef1e1Q9D1M4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eef1e1Q9D1M4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eef1e1Q9D1M4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eef1e1Q9D1M4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eef1e1Q9D1M4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eef1e1Q9D1M4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eef1e1Q9D1M4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Eef1e1Q9D1M4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Eef1e1Q9D1M4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Eef1e1Q9D1M4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Eef1e1Q9D1M4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eef1e1Q9D1M4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eef1e1Q9D1M4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144 ms