Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rrs1Q9CYH6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Rrs1Q9CYH6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rrs1Q9CYH6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rrs1Q9CYH6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rrs1Q9CYH6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rrs1Q9CYH6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Rrs1Q9CYH6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rrs1Q9CYH6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rrs1Q9CYH6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rrs1Q9CYH6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rrs1Q9CYH6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rrs1Q9CYH6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rrs1Q9CYH6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rrs1Q9CYH6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rrs1Q9CYH6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rrs1Q9CYH6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rrs1Q9CYH6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Rrs1Q9CYH6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Rrs1Q9CYH6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Rrs1Q9CYH6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Rrs1Q9CYH6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rrs1Q9CYH6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rrs1Q9CYH6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rrs1Q9CYH6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rrs1Q9CYH6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rrs1Q9CYH6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rrs1Q9CYH6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rrs1Q9CYH6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rrs1Q9CYH6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rrs1Q9CYH6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rrs1Q9CYH6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rrs1Q9CYH6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rrs1Q9CYH6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rrs1Q9CYH6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rrs1Q9CYH6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rrs1Q9CYH6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rrs1Q9CYH6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rrs1Q9CYH6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rrs1Q9CYH6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rrs1Q9CYH6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rrs1Q9CYH6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rrs1Q9CYH6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rrs1Q9CYH6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rrs1Q9CYH6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rrs1Q9CYH6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rrs1Q9CYH6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rrs1Q9CYH6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rrs1Q9CYH6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rrs1Q9CYH6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rrs1Q9CYH6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rrs1Q9CYH6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rrs1Q9CYH6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrs1Q9CYH6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrs1Q9CYH6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrs1Q9CYH6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrs1Q9CYH6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrs1Q9CYH6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrs1Q9CYH6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrs1Q9CYH6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrs1Q9CYH6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrs1Q9CYH6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrs1Q9CYH6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrs1Q9CYH6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrs1Q9CYH6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrs1Q9CYH6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrs1Q9CYH6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrs1Q9CYH6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrs1Q9CYH6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrs1Q9CYH6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrs1Q9CYH6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrs1Q9CYH6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrs1Q9CYH6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrs1Q9CYH6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrs1Q9CYH6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms