Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm8Q9CXT6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Kdm8Q9CXT6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kdm8Q9CXT6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm8Q9CXT6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.1 ms