Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sgo1Q9CXH7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sgo1Q9CXH7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sgo1Q9CXH7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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