Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Xrcc3Q9CXE6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Xrcc3Q9CXE6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Xrcc3Q9CXE6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xrcc3Q9CXE6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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