Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx47Q9CWX9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx47Q9CWX9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx47Q9CWX9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx47Q9CWX9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx47Q9CWX9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx47Q9CWX9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx47Q9CWX9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx47Q9CWX9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx47Q9CWX9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx47Q9CWX9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx47Q9CWX9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx47Q9CWX9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx47Q9CWX9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx47Q9CWX9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx47Q9CWX9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx47Q9CWX9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx47Q9CWX9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx47Q9CWX9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx47Q9CWX9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx47Q9CWX9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx47Q9CWX9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx47Q9CWX9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx47Q9CWX9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx47Q9CWX9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx47Q9CWX9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx47Q9CWX9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx47Q9CWX9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx47Q9CWX9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx47Q9CWX9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx47Q9CWX9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx47Q9CWX9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx47Q9CWX9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ddx47Q9CWX9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ddx47Q9CWX9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ddx47Q9CWX9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx47Q9CWX9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx47Q9CWX9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx47Q9CWX9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx47Q9CWX9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx47Q9CWX9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx47Q9CWX9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx47Q9CWX9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx47Q9CWX9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx47Q9CWX9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx47Q9CWX9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx47Q9CWX9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx47Q9CWX9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx47Q9CWX9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx47Q9CWX9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx47Q9CWX9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx47Q9CWX9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx47Q9CWX9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx47Q9CWX9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx47Q9CWX9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx47Q9CWX9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx47Q9CWX9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx47Q9CWX9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx47Q9CWX9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ddx47Q9CWX9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx47Q9CWX9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx47Q9CWX9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx47Q9CWX9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx47Q9CWX9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx47Q9CWX9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx47Q9CWX9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx47Q9CWX9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx47Q9CWX9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx47Q9CWX9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx47Q9CWX9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx47Q9CWX9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx47Q9CWX9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx47Q9CWX9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx47Q9CWX9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx47Q9CWX9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx47Q9CWX9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx47Q9CWX9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx47Q9CWX9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx47Q9CWX9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx47Q9CWX9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx47Q9CWX9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx47Q9CWX9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx47Q9CWX9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx47Q9CWX9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms