Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Malsu1Q9CWV0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Malsu1Q9CWV0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Malsu1Q9CWV0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms