Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd12Q9CWU0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd12Q9CWU0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd12Q9CWU0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd12Q9CWU0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd12Q9CWU0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd12Q9CWU0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd12Q9CWU0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tdrd12Q9CWU0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tdrd12Q9CWU0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tdrd12Q9CWU0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tdrd12Q9CWU0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tdrd12Q9CWU0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tdrd12Q9CWU0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tdrd12Q9CWU0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd12Q9CWU0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tdrd12Q9CWU0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tdrd12Q9CWU0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tdrd12Q9CWU0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tdrd12Q9CWU0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tdrd12Q9CWU0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd12Q9CWU0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd12Q9CWU0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tdrd12Q9CWU0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tdrd12Q9CWU0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tdrd12Q9CWU0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tdrd12Q9CWU0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tdrd12Q9CWU0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tdrd12Q9CWU0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tdrd12Q9CWU0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tdrd12Q9CWU0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tdrd12Q9CWU0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tdrd12Q9CWU0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tdrd12Q9CWU0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tdrd12Q9CWU0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tdrd12Q9CWU0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tdrd12Q9CWU0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tdrd12Q9CWU0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tdrd12Q9CWU0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tdrd12Q9CWU0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tdrd12Q9CWU0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tdrd12Q9CWU0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tdrd12Q9CWU0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tdrd12Q9CWU0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tdrd12Q9CWU0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tdrd12Q9CWU0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tdrd12Q9CWU0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tdrd12Q9CWU0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tdrd12Q9CWU0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tdrd12Q9CWU0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tdrd12Q9CWU0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tdrd12Q9CWU0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tdrd12Q9CWU0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tdrd12Q9CWU0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tdrd12Q9CWU0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tdrd12Q9CWU0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tdrd12Q9CWU0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tdrd12Q9CWU0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tdrd12Q9CWU0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tdrd12Q9CWU0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tdrd12Q9CWU0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tdrd12Q9CWU0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tdrd12Q9CWU0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tdrd12Q9CWU0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tdrd12Q9CWU0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tdrd12Q9CWU0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tdrd12Q9CWU0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tdrd12Q9CWU0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tdrd12Q9CWU0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tdrd12Q9CWU0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tdrd12Q9CWU0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd12Q9CWU0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd12Q9CWU0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd12Q9CWU0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd12Q9CWU0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd12Q9CWU0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd12Q9CWU0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd12Q9CWU0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd12Q9CWU0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd12Q9CWU0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd12Q9CWU0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd12Q9CWU0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd12Q9CWU0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd12Q9CWU0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tdrd12Q9CWU0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 230.1 ms