Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR99

4930544G11Rik, RIKEN cDNA 4930544G11, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544G11RikQ9CR99 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
4930544G11RikQ9CR99 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930544G11RikQ9CR99 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544G11RikQ9CR99 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930544G11RikQ9CR99 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930544G11RikQ9CR99 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930544G11RikQ9CR99 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930544G11RikQ9CR99 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930544G11RikQ9CR99 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms