Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DenrQ9CQJ6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DenrQ9CQJ6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DenrQ9CQJ6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DenrQ9CQJ6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DenrQ9CQJ6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DenrQ9CQJ6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DenrQ9CQJ6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DenrQ9CQJ6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DenrQ9CQJ6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DenrQ9CQJ6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DenrQ9CQJ6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DenrQ9CQJ6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DenrQ9CQJ6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DenrQ9CQJ6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DenrQ9CQJ6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DenrQ9CQJ6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DenrQ9CQJ6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DenrQ9CQJ6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms