Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,35■□□□□ 0,21
Higd2aQ9CQJ1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,35■□□□□ 0,21
Higd2aQ9CQJ1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,35■□□□□ 0,21
Higd2aQ9CQJ1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,35■□□□□ 0,21
Higd2aQ9CQJ1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,35■□□□□ 0,21
Higd2aQ9CQJ1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16,35■□□□□ 0,21
Higd2aQ9CQJ1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,35■□□□□ 0,21
Higd2aQ9CQJ1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,35■□□□□ 0,21
Higd2aQ9CQJ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16,34■□□□□ 0,21
Higd2aQ9CQJ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,34■□□□□ 0,21
Higd2aQ9CQJ1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,34■□□□□ 0,21
Higd2aQ9CQJ1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16,34■□□□□ 0,21
Higd2aQ9CQJ1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16,34■□□□□ 0,21
Higd2aQ9CQJ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,34■□□□□ 0,21
Higd2aQ9CQJ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,34■□□□□ 0,21
Higd2aQ9CQJ1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,21
Higd2aQ9CQJ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16,33■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16,32■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16,32■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16,31■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16,31■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,31■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16,31■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,31■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16,3■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16,3■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16,3■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16,3■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,3■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,29■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,29■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16,29■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16,29■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16,29■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,28■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,28■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,28■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,28■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,28■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16,28■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16,28■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16,28■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16,28■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16,28■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16,28■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16,28■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,28■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16,28■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16,27■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16,27■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16,27■□□□□ 0,2
Higd2aQ9CQJ1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
Higd2aQ9CQJ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
Higd2aQ9CQJ1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
Higd2aQ9CQJ1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
Higd2aQ9CQJ1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
Higd2aQ9CQJ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
Higd2aQ9CQJ1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Higd2aQ9CQJ1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16,25■□□□□ 0,19
Higd2aQ9CQJ1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16,25■□□□□ 0,19
Higd2aQ9CQJ1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Higd2aQ9CQJ1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Higd2aQ9CQJ1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Higd2aQ9CQJ1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,24■□□□□ 0,19
Higd2aQ9CQJ1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,24■□□□□ 0,19
Higd2aQ9CQJ1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,24■□□□□ 0,19
Higd2aQ9CQJ1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,24■□□□□ 0,19
Higd2aQ9CQJ1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,24■□□□□ 0,19
Higd2aQ9CQJ1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16,22■□□□□ 0,19
Higd2aQ9CQJ1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Higd2aQ9CQJ1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Higd2aQ9CQJ1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Higd2aQ9CQJ1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Higd2aQ9CQJ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Higd2aQ9CQJ1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16,21■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,2■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16,2■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16,2■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16,19■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16,19■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,18■□□□□ 0,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,2 ms