Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ5

Col25a1, Collagen alpha-1(XXV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col25a1Q99MQ5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col25a1Q99MQ5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col25a1Q99MQ5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col25a1Q99MQ5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col25a1Q99MQ5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col25a1Q99MQ5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Col25a1Q99MQ5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col25a1Q99MQ5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Col25a1Q99MQ5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col25a1Q99MQ5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col25a1Q99MQ5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col25a1Q99MQ5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Col25a1Q99MQ5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col25a1Q99MQ5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col25a1Q99MQ5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col25a1Q99MQ5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col25a1Q99MQ5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col25a1Q99MQ5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col25a1Q99MQ5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col25a1Q99MQ5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col25a1Q99MQ5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Col25a1Q99MQ5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col25a1Q99MQ5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col25a1Q99MQ5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col25a1Q99MQ5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col25a1Q99MQ5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col25a1Q99MQ5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Col25a1Q99MQ5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Col25a1Q99MQ5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col25a1Q99MQ5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col25a1Q99MQ5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col25a1Q99MQ5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col25a1Q99MQ5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col25a1Q99MQ5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col25a1Q99MQ5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Col25a1Q99MQ5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col25a1Q99MQ5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col25a1Q99MQ5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col25a1Q99MQ5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col25a1Q99MQ5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col25a1Q99MQ5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col25a1Q99MQ5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col25a1Q99MQ5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col25a1Q99MQ5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col25a1Q99MQ5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col25a1Q99MQ5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col25a1Q99MQ5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col25a1Q99MQ5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col25a1Q99MQ5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col25a1Q99MQ5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col25a1Q99MQ5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col25a1Q99MQ5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col25a1Q99MQ5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col25a1Q99MQ5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col25a1Q99MQ5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col25a1Q99MQ5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col25a1Q99MQ5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col25a1Q99MQ5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col25a1Q99MQ5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col25a1Q99MQ5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col25a1Q99MQ5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col25a1Q99MQ5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col25a1Q99MQ5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col25a1Q99MQ5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col25a1Q99MQ5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col25a1Q99MQ5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Col25a1Q99MQ5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col25a1Q99MQ5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Col25a1Q99MQ5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col25a1Q99MQ5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col25a1Q99MQ5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col25a1Q99MQ5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col25a1Q99MQ5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Col25a1Q99MQ5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Col25a1Q99MQ5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col25a1Q99MQ5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col25a1Q99MQ5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col25a1Q99MQ5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col25a1Q99MQ5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col25a1Q99MQ5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col25a1Q99MQ5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col25a1Q99MQ5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col25a1Q99MQ5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col25a1Q99MQ5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col25a1Q99MQ5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col25a1Q99MQ5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col25a1Q99MQ5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col25a1Q99MQ5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col25a1Q99MQ5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col25a1Q99MQ5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col25a1Q99MQ5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col25a1Q99MQ5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col25a1Q99MQ5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col25a1Q99MQ5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Col25a1Q99MQ5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col25a1Q99MQ5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col25a1Q99MQ5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col25a1Q99MQ5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col25a1Q99MQ5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col25a1Q99MQ5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms