Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH2

Ptdss1, Phosphatidylserine synthase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptdss1Q99LH2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptdss1Q99LH2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptdss1Q99LH2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptdss1Q99LH2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptdss1Q99LH2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptdss1Q99LH2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptdss1Q99LH2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptdss1Q99LH2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptdss1Q99LH2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptdss1Q99LH2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptdss1Q99LH2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptdss1Q99LH2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptdss1Q99LH2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptdss1Q99LH2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptdss1Q99LH2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptdss1Q99LH2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptdss1Q99LH2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptdss1Q99LH2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptdss1Q99LH2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptdss1Q99LH2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptdss1Q99LH2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptdss1Q99LH2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptdss1Q99LH2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptdss1Q99LH2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptdss1Q99LH2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptdss1Q99LH2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptdss1Q99LH2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptdss1Q99LH2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptdss1Q99LH2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptdss1Q99LH2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptdss1Q99LH2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptdss1Q99LH2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptdss1Q99LH2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptdss1Q99LH2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptdss1Q99LH2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptdss1Q99LH2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptdss1Q99LH2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptdss1Q99LH2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptdss1Q99LH2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptdss1Q99LH2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptdss1Q99LH2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptdss1Q99LH2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptdss1Q99LH2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptdss1Q99LH2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptdss1Q99LH2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptdss1Q99LH2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptdss1Q99LH2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptdss1Q99LH2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptdss1Q99LH2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptdss1Q99LH2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptdss1Q99LH2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptdss1Q99LH2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptdss1Q99LH2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptdss1Q99LH2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptdss1Q99LH2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptdss1Q99LH2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptdss1Q99LH2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptdss1Q99LH2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptdss1Q99LH2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ptdss1Q99LH2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptdss1Q99LH2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptdss1Q99LH2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptdss1Q99LH2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptdss1Q99LH2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptdss1Q99LH2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptdss1Q99LH2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptdss1Q99LH2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptdss1Q99LH2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptdss1Q99LH2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptdss1Q99LH2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptdss1Q99LH2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms