Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nmd3Q99L48 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nmd3Q99L48 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nmd3Q99L48 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nmd3Q99L48 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nmd3Q99L48 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nmd3Q99L48 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nmd3Q99L48 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nmd3Q99L48 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nmd3Q99L48 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nmd3Q99L48 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nmd3Q99L48 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nmd3Q99L48 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nmd3Q99L48 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nmd3Q99L48 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nmd3Q99L48 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nmd3Q99L48 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nmd3Q99L48 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nmd3Q99L48 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nmd3Q99L48 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nmd3Q99L48 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nmd3Q99L48 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nmd3Q99L48 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nmd3Q99L48 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nmd3Q99L48 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nmd3Q99L48 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nmd3Q99L48 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.8 ms