Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PpifQ99KR7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PpifQ99KR7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PpifQ99KR7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms