Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GatbQ99JT1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GatbQ99JT1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GatbQ99JT1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GatbQ99JT1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GatbQ99JT1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GatbQ99JT1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GatbQ99JT1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GatbQ99JT1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GatbQ99JT1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GatbQ99JT1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GatbQ99JT1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GatbQ99JT1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GatbQ99JT1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GatbQ99JT1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GatbQ99JT1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GatbQ99JT1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GatbQ99JT1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GatbQ99JT1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GatbQ99JT1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GatbQ99JT1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GatbQ99JT1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GatbQ99JT1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GatbQ99JT1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GatbQ99JT1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms