Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddb2Q99J79 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddb2Q99J79 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddb2Q99J79 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddb2Q99J79 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddb2Q99J79 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddb2Q99J79 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddb2Q99J79 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddb2Q99J79 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddb2Q99J79 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddb2Q99J79 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddb2Q99J79 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddb2Q99J79 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddb2Q99J79 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddb2Q99J79 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddb2Q99J79 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddb2Q99J79 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddb2Q99J79 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddb2Q99J79 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddb2Q99J79 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddb2Q99J79 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddb2Q99J79 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddb2Q99J79 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddb2Q99J79 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddb2Q99J79 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms