Protein–RNA interactions for Protein: Q96EQ9

Prdm9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm9Q96EQ9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm9Q96EQ9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm9Q96EQ9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm9Q96EQ9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm9Q96EQ9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm9Q96EQ9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm9Q96EQ9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm9Q96EQ9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm9Q96EQ9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm9Q96EQ9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm9Q96EQ9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm9Q96EQ9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm9Q96EQ9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm9Q96EQ9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm9Q96EQ9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm9Q96EQ9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm9Q96EQ9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm9Q96EQ9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms