Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmo1Q924W9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmo1Q924W9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmo1Q924W9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmo1Q924W9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmo1Q924W9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmo1Q924W9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmo1Q924W9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmo1Q924W9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmo1Q924W9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmo1Q924W9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmo1Q924W9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmo1Q924W9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmo1Q924W9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmo1Q924W9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmo1Q924W9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lmo1Q924W9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmo1Q924W9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms