Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q2

Riok1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok1Q922Q2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Riok1Q922Q2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Riok1Q922Q2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Riok1Q922Q2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Riok1Q922Q2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Riok1Q922Q2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Riok1Q922Q2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Riok1Q922Q2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Riok1Q922Q2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Riok1Q922Q2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Riok1Q922Q2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Riok1Q922Q2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Riok1Q922Q2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Riok1Q922Q2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Riok1Q922Q2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Riok1Q922Q2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Riok1Q922Q2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Riok1Q922Q2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Riok1Q922Q2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Riok1Q922Q2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Riok1Q922Q2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Riok1Q922Q2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Riok1Q922Q2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Riok1Q922Q2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Riok1Q922Q2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Riok1Q922Q2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Riok1Q922Q2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Riok1Q922Q2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Riok1Q922Q2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Riok1Q922Q2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Riok1Q922Q2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Riok1Q922Q2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Riok1Q922Q2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Riok1Q922Q2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Riok1Q922Q2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Riok1Q922Q2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Riok1Q922Q2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Riok1Q922Q2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Riok1Q922Q2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Riok1Q922Q2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Riok1Q922Q2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Riok1Q922Q2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Riok1Q922Q2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Riok1Q922Q2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Riok1Q922Q2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Riok1Q922Q2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Riok1Q922Q2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Riok1Q922Q2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Riok1Q922Q2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Riok1Q922Q2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Riok1Q922Q2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Riok1Q922Q2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Riok1Q922Q2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Riok1Q922Q2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Riok1Q922Q2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Riok1Q922Q2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Riok1Q922Q2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Riok1Q922Q2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Riok1Q922Q2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Riok1Q922Q2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Riok1Q922Q2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Riok1Q922Q2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Riok1Q922Q2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Riok1Q922Q2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Riok1Q922Q2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Riok1Q922Q2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Riok1Q922Q2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Riok1Q922Q2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Riok1Q922Q2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Riok1Q922Q2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Riok1Q922Q2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms