Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Supt16hQ920B9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Supt16hQ920B9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Supt16hQ920B9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Supt16hQ920B9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Supt16hQ920B9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Supt16hQ920B9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Supt16hQ920B9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Supt16hQ920B9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Supt16hQ920B9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Supt16hQ920B9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Supt16hQ920B9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Supt16hQ920B9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Supt16hQ920B9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Supt16hQ920B9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Supt16hQ920B9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Supt16hQ920B9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Supt16hQ920B9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Supt16hQ920B9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt16hQ920B9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt16hQ920B9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt16hQ920B9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt16hQ920B9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Supt16hQ920B9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Supt16hQ920B9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Supt16hQ920B9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Supt16hQ920B9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Supt16hQ920B9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Supt16hQ920B9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Supt16hQ920B9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Supt16hQ920B9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Supt16hQ920B9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Supt16hQ920B9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Supt16hQ920B9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Supt16hQ920B9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Supt16hQ920B9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Supt16hQ920B9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Supt16hQ920B9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Supt16hQ920B9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Supt16hQ920B9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Supt16hQ920B9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Supt16hQ920B9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Supt16hQ920B9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Supt16hQ920B9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Supt16hQ920B9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Supt16hQ920B9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Supt16hQ920B9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Supt16hQ920B9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Supt16hQ920B9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Supt16hQ920B9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Supt16hQ920B9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Supt16hQ920B9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Supt16hQ920B9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Supt16hQ920B9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Supt16hQ920B9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Supt16hQ920B9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Supt16hQ920B9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Supt16hQ920B9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Supt16hQ920B9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Supt16hQ920B9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Supt16hQ920B9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Supt16hQ920B9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Supt16hQ920B9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Supt16hQ920B9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Supt16hQ920B9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Supt16hQ920B9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Supt16hQ920B9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Supt16hQ920B9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Supt16hQ920B9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Supt16hQ920B9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Supt16hQ920B9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Supt16hQ920B9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Supt16hQ920B9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Supt16hQ920B9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms