Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snx18Q91ZR2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx18Q91ZR2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms