Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Trpm2Q91YD4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Trpm2Q91YD4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Trpm2Q91YD4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Trpm2Q91YD4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Trpm2Q91YD4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Trpm2Q91YD4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Trpm2Q91YD4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Trpm2Q91YD4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Trpm2Q91YD4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Trpm2Q91YD4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Trpm2Q91YD4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Trpm2Q91YD4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Trpm2Q91YD4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Trpm2Q91YD4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Trpm2Q91YD4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Trpm2Q91YD4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Trpm2Q91YD4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Trpm2Q91YD4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Trpm2Q91YD4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Trpm2Q91YD4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Trpm2Q91YD4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Trpm2Q91YD4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Trpm2Q91YD4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Trpm2Q91YD4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Trpm2Q91YD4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Trpm2Q91YD4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Trpm2Q91YD4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Trpm2Q91YD4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Trpm2Q91YD4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Trpm2Q91YD4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Trpm2Q91YD4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Trpm2Q91YD4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Trpm2Q91YD4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Trpm2Q91YD4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Trpm2Q91YD4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Trpm2Q91YD4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Trpm2Q91YD4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Trpm2Q91YD4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Trpm2Q91YD4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Trpm2Q91YD4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Trpm2Q91YD4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Trpm2Q91YD4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Trpm2Q91YD4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Trpm2Q91YD4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Trpm2Q91YD4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Trpm2Q91YD4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Trpm2Q91YD4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Trpm2Q91YD4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Trpm2Q91YD4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Trpm2Q91YD4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Trpm2Q91YD4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Trpm2Q91YD4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Trpm2Q91YD4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Trpm2Q91YD4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Trpm2Q91YD4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Trpm2Q91YD4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Trpm2Q91YD4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Trpm2Q91YD4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Trpm2Q91YD4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Trpm2Q91YD4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Trpm2Q91YD4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Trpm2Q91YD4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Trpm2Q91YD4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Trpm2Q91YD4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Trpm2Q91YD4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Trpm2Q91YD4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Trpm2Q91YD4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Trpm2Q91YD4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Trpm2Q91YD4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Trpm2Q91YD4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Trpm2Q91YD4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Trpm2Q91YD4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Trpm2Q91YD4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Trpm2Q91YD4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Trpm2Q91YD4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Trpm2Q91YD4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Trpm2Q91YD4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Trpm2Q91YD4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Trpm2Q91YD4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Trpm2Q91YD4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Trpm2Q91YD4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Trpm2Q91YD4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Trpm2Q91YD4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Trpm2Q91YD4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Trpm2Q91YD4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Trpm2Q91YD4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Trpm2Q91YD4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Trpm2Q91YD4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Trpm2Q91YD4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Trpm2Q91YD4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Trpm2Q91YD4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Trpm2Q91YD4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms