Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y15

Pcdha5, Protocadherin alpha 5, mousemouse

Predictions only

Length 934 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha5Q91Y15 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha5Q91Y15 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha5Q91Y15 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha5Q91Y15 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha5Q91Y15 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha5Q91Y15 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha5Q91Y15 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha5Q91Y15 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha5Q91Y15 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha5Q91Y15 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha5Q91Y15 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha5Q91Y15 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha5Q91Y15 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha5Q91Y15 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha5Q91Y15 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha5Q91Y15 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha5Q91Y15 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha5Q91Y15 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha5Q91Y15 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms