Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdhb12Q91Y07 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcdhb12Q91Y07 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcdhb12Q91Y07 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcdhb12Q91Y07 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcdhb12Q91Y07 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcdhb12Q91Y07 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcdhb12Q91Y07 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdhb12Q91Y07 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdhb12Q91Y07 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdhb12Q91Y07 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdhb12Q91Y07 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdhb12Q91Y07 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdhb12Q91Y07 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcdhb12Q91Y07 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcdhb12Q91Y07 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcdhb12Q91Y07 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdhb12Q91Y07 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdhb12Q91Y07 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdhb12Q91Y07 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdhb12Q91Y07 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pcdhb12Q91Y07 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pcdhb12Q91Y07 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcdhb12Q91Y07 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdhb12Q91Y07 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdhb12Q91Y07 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdhb12Q91Y07 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdhb12Q91Y07 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdhb12Q91Y07 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdhb12Q91Y07 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdhb12Q91Y07 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdhb12Q91Y07 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdhb12Q91Y07 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdhb12Q91Y07 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcdhb12Q91Y07 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcdhb12Q91Y07 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcdhb12Q91Y07 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcdhb12Q91Y07 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pcdhb12Q91Y07 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcdhb12Q91Y07 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcdhb12Q91Y07 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcdhb12Q91Y07 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcdhb12Q91Y07 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcdhb12Q91Y07 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcdhb12Q91Y07 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcdhb12Q91Y07 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcdhb12Q91Y07 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcdhb12Q91Y07 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcdhb12Q91Y07 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcdhb12Q91Y07 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcdhb12Q91Y07 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcdhb12Q91Y07 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcdhb12Q91Y07 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcdhb12Q91Y07 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcdhb12Q91Y07 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcdhb12Q91Y07 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcdhb12Q91Y07 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcdhb12Q91Y07 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcdhb12Q91Y07 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcdhb12Q91Y07 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.3 ms