Protein–RNA interactions for Protein: Q91V10

Vsx1, Visual system homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1Q91V10 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vsx1Q91V10 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vsx1Q91V10 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vsx1Q91V10 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vsx1Q91V10 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vsx1Q91V10 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vsx1Q91V10 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vsx1Q91V10 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vsx1Q91V10 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vsx1Q91V10 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vsx1Q91V10 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vsx1Q91V10 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vsx1Q91V10 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vsx1Q91V10 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vsx1Q91V10 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vsx1Q91V10 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vsx1Q91V10 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vsx1Q91V10 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vsx1Q91V10 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vsx1Q91V10 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vsx1Q91V10 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vsx1Q91V10 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vsx1Q91V10 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vsx1Q91V10 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vsx1Q91V10 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vsx1Q91V10 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vsx1Q91V10 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vsx1Q91V10 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vsx1Q91V10 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vsx1Q91V10 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vsx1Q91V10 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vsx1Q91V10 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vsx1Q91V10 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vsx1Q91V10 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vsx1Q91V10 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vsx1Q91V10 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vsx1Q91V10 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vsx1Q91V10 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vsx1Q91V10 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vsx1Q91V10 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vsx1Q91V10 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vsx1Q91V10 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vsx1Q91V10 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms