Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps4aQ8VEJ9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps4aQ8VEJ9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps4aQ8VEJ9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps4aQ8VEJ9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps4aQ8VEJ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps4aQ8VEJ9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps4aQ8VEJ9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps4aQ8VEJ9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps4aQ8VEJ9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps4aQ8VEJ9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps4aQ8VEJ9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps4aQ8VEJ9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps4aQ8VEJ9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps4aQ8VEJ9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps4aQ8VEJ9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps4aQ8VEJ9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps4aQ8VEJ9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps4aQ8VEJ9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps4aQ8VEJ9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps4aQ8VEJ9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps4aQ8VEJ9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps4aQ8VEJ9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps4aQ8VEJ9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vps4aQ8VEJ9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps4aQ8VEJ9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps4aQ8VEJ9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms