Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cul7Q8VE73 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cul7Q8VE73 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cul7Q8VE73 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cul7Q8VE73 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cul7Q8VE73 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cul7Q8VE73 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cul7Q8VE73 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cul7Q8VE73 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cul7Q8VE73 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cul7Q8VE73 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cul7Q8VE73 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cul7Q8VE73 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cul7Q8VE73 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cul7Q8VE73 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Cul7Q8VE73 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cul7Q8VE73 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cul7Q8VE73 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cul7Q8VE73 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Cul7Q8VE73 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cul7Q8VE73 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cul7Q8VE73 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cul7Q8VE73 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cul7Q8VE73 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cul7Q8VE73 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cul7Q8VE73 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Cul7Q8VE73 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Cul7Q8VE73 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Cul7Q8VE73 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Cul7Q8VE73 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cul7Q8VE73 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cul7Q8VE73 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cul7Q8VE73 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
Cul7Q8VE73 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
Cul7Q8VE73 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Cul7Q8VE73 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Cul7Q8VE73 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Cul7Q8VE73 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cul7Q8VE73 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cul7Q8VE73 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Cul7Q8VE73 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cul7Q8VE73 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cul7Q8VE73 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cul7Q8VE73 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cul7Q8VE73 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Cul7Q8VE73 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cul7Q8VE73 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cul7Q8VE73 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cul7Q8VE73 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cul7Q8VE73 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cul7Q8VE73 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Cul7Q8VE73 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Cul7Q8VE73 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Cul7Q8VE73 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cul7Q8VE73 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cul7Q8VE73 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Cul7Q8VE73 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Cul7Q8VE73 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Cul7Q8VE73 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cul7Q8VE73 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cul7Q8VE73 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cul7Q8VE73 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cul7Q8VE73 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cul7Q8VE73 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cul7Q8VE73 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cul7Q8VE73 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cul7Q8VE73 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cul7Q8VE73 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cul7Q8VE73 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cul7Q8VE73 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cul7Q8VE73 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cul7Q8VE73 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cul7Q8VE73 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cul7Q8VE73 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cul7Q8VE73 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms