Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4C2

Rufy2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy2Q8R4C2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
Rufy2Q8R4C2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Rufy2Q8R4C2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Rufy2Q8R4C2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Rufy2Q8R4C2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Rufy2Q8R4C2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26,82■■□□□ 1,88
Rufy2Q8R4C2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Rufy2Q8R4C2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Rufy2Q8R4C2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Rufy2Q8R4C2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Rufy2Q8R4C2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Rufy2Q8R4C2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Rufy2Q8R4C2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Rufy2Q8R4C2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Rufy2Q8R4C2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Rufy2Q8R4C2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Rufy2Q8R4C2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Rufy2Q8R4C2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Rufy2Q8R4C2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Rufy2Q8R4C2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Rufy2Q8R4C2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Rufy2Q8R4C2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Rufy2Q8R4C2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Rufy2Q8R4C2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Rufy2Q8R4C2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Rufy2Q8R4C2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Rufy2Q8R4C2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Rufy2Q8R4C2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Rufy2Q8R4C2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Rufy2Q8R4C2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Rufy2Q8R4C2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Rufy2Q8R4C2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Rufy2Q8R4C2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Rufy2Q8R4C2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Rufy2Q8R4C2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26,72■■□□□ 1,87
Rufy2Q8R4C2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Rufy2Q8R4C2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Rufy2Q8R4C2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Rufy2Q8R4C2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Rufy2Q8R4C2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Rufy2Q8R4C2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Rufy2Q8R4C2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Rufy2Q8R4C2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Rufy2Q8R4C2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Rufy2Q8R4C2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Rufy2Q8R4C2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26,69■■□□□ 1,86
Rufy2Q8R4C2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Rufy2Q8R4C2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Rufy2Q8R4C2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Rufy2Q8R4C2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Rufy2Q8R4C2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Rufy2Q8R4C2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Rufy2Q8R4C2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Rufy2Q8R4C2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Rufy2Q8R4C2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Rufy2Q8R4C2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Rufy2Q8R4C2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Rufy2Q8R4C2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Rufy2Q8R4C2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Rufy2Q8R4C2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Rufy2Q8R4C2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Rufy2Q8R4C2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Rufy2Q8R4C2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Rufy2Q8R4C2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Rufy2Q8R4C2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Rufy2Q8R4C2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,85
Rufy2Q8R4C2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,85
Rufy2Q8R4C2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Rufy2Q8R4C2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Rufy2Q8R4C2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Rufy2Q8R4C2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Rufy2Q8R4C2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Rufy2Q8R4C2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Rufy2Q8R4C2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Rufy2Q8R4C2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,59■■□□□ 1,85
Rufy2Q8R4C2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Rufy2Q8R4C2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Rufy2Q8R4C2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Rufy2Q8R4C2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Rufy2Q8R4C2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Rufy2Q8R4C2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Rufy2Q8R4C2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26,58■■□□□ 1,85
Rufy2Q8R4C2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26,58■■□□□ 1,85
Rufy2Q8R4C2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Rufy2Q8R4C2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Rufy2Q8R4C2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26,58■■□□□ 1,84
Rufy2Q8R4C2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Rufy2Q8R4C2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Rufy2Q8R4C2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Rufy2Q8R4C2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Rufy2Q8R4C2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Rufy2Q8R4C2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Rufy2Q8R4C2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Rufy2Q8R4C2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Rufy2Q8R4C2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Rufy2Q8R4C2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Rufy2Q8R4C2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Rufy2Q8R4C2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Rufy2Q8R4C2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26,54■■□□□ 1,84
Rufy2Q8R4C2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms