Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
0610009B22RikQ8R3W2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
0610009B22RikQ8R3W2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
0610009B22RikQ8R3W2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
0610009B22RikQ8R3W2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms