Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2K6

Agfg1, Arf-GAP domain and FG repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agfg1Q8K2K6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Agfg1Q8K2K6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Agfg1Q8K2K6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Agfg1Q8K2K6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Agfg1Q8K2K6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Agfg1Q8K2K6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Agfg1Q8K2K6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Agfg1Q8K2K6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Agfg1Q8K2K6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Agfg1Q8K2K6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Agfg1Q8K2K6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Agfg1Q8K2K6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Agfg1Q8K2K6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Agfg1Q8K2K6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Agfg1Q8K2K6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Agfg1Q8K2K6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Agfg1Q8K2K6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Agfg1Q8K2K6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Agfg1Q8K2K6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Agfg1Q8K2K6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Agfg1Q8K2K6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Agfg1Q8K2K6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Agfg1Q8K2K6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Agfg1Q8K2K6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Agfg1Q8K2K6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Agfg1Q8K2K6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Agfg1Q8K2K6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Agfg1Q8K2K6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Agfg1Q8K2K6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Agfg1Q8K2K6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Agfg1Q8K2K6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Agfg1Q8K2K6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Agfg1Q8K2K6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Agfg1Q8K2K6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Agfg1Q8K2K6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Agfg1Q8K2K6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Agfg1Q8K2K6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Agfg1Q8K2K6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Agfg1Q8K2K6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Agfg1Q8K2K6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Agfg1Q8K2K6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Agfg1Q8K2K6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Agfg1Q8K2K6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Agfg1Q8K2K6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Agfg1Q8K2K6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Agfg1Q8K2K6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Agfg1Q8K2K6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Agfg1Q8K2K6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Agfg1Q8K2K6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Agfg1Q8K2K6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Agfg1Q8K2K6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Agfg1Q8K2K6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Agfg1Q8K2K6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Agfg1Q8K2K6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Agfg1Q8K2K6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Agfg1Q8K2K6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Agfg1Q8K2K6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Agfg1Q8K2K6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Agfg1Q8K2K6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Agfg1Q8K2K6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Agfg1Q8K2K6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Agfg1Q8K2K6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Agfg1Q8K2K6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Agfg1Q8K2K6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Agfg1Q8K2K6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Agfg1Q8K2K6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Agfg1Q8K2K6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Agfg1Q8K2K6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Agfg1Q8K2K6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Agfg1Q8K2K6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Agfg1Q8K2K6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Agfg1Q8K2K6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Agfg1Q8K2K6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms