Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arfip2Q8K221 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Arfip2Q8K221 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfip2Q8K221 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arfip2Q8K221 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arfip2Q8K221 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arfip2Q8K221 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arfip2Q8K221 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms