Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Spire2Q8K1S6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Spire2Q8K1S6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Spire2Q8K1S6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Spire2Q8K1S6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Spire2Q8K1S6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Spire2Q8K1S6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Spire2Q8K1S6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Spire2Q8K1S6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Spire2Q8K1S6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Spire2Q8K1S6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Spire2Q8K1S6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Spire2Q8K1S6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Spire2Q8K1S6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Spire2Q8K1S6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Spire2Q8K1S6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Spire2Q8K1S6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Spire2Q8K1S6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Spire2Q8K1S6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Spire2Q8K1S6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Spire2Q8K1S6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Spire2Q8K1S6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Spire2Q8K1S6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Spire2Q8K1S6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Spire2Q8K1S6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Spire2Q8K1S6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Spire2Q8K1S6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Spire2Q8K1S6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Spire2Q8K1S6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Spire2Q8K1S6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Spire2Q8K1S6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Spire2Q8K1S6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Spire2Q8K1S6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Spire2Q8K1S6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Spire2Q8K1S6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Spire2Q8K1S6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Spire2Q8K1S6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Spire2Q8K1S6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Spire2Q8K1S6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Spire2Q8K1S6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Spire2Q8K1S6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Spire2Q8K1S6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Spire2Q8K1S6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Spire2Q8K1S6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Spire2Q8K1S6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Spire2Q8K1S6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Spire2Q8K1S6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Spire2Q8K1S6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Spire2Q8K1S6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Spire2Q8K1S6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Spire2Q8K1S6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Spire2Q8K1S6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Spire2Q8K1S6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Spire2Q8K1S6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Spire2Q8K1S6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Spire2Q8K1S6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Spire2Q8K1S6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Spire2Q8K1S6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Spire2Q8K1S6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Spire2Q8K1S6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Spire2Q8K1S6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Spire2Q8K1S6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Spire2Q8K1S6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Spire2Q8K1S6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Spire2Q8K1S6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Spire2Q8K1S6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Spire2Q8K1S6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Spire2Q8K1S6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Spire2Q8K1S6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Spire2Q8K1S6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Spire2Q8K1S6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Spire2Q8K1S6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms