Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIP4

Mark4, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark4Q8CIP4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mark4Q8CIP4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Mark4Q8CIP4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mark4Q8CIP4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms