Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIK8

Rfwd3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, mousemouse

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd3Q8CIK8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rfwd3Q8CIK8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfwd3Q8CIK8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfwd3Q8CIK8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfwd3Q8CIK8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfwd3Q8CIK8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfwd3Q8CIK8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfwd3Q8CIK8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfwd3Q8CIK8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfwd3Q8CIK8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfwd3Q8CIK8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfwd3Q8CIK8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfwd3Q8CIK8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfwd3Q8CIK8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfwd3Q8CIK8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfwd3Q8CIK8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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