Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI85

Ca12, Carbonic anhydrase 12, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca12Q8CI85 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ca12Q8CI85 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ca12Q8CI85 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ca12Q8CI85 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ca12Q8CI85 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ca12Q8CI85 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ca12Q8CI85 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ca12Q8CI85 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ca12Q8CI85 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ca12Q8CI85 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ca12Q8CI85 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ca12Q8CI85 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ca12Q8CI85 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ca12Q8CI85 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ca12Q8CI85 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ca12Q8CI85 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ca12Q8CI85 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ca12Q8CI85 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ca12Q8CI85 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ca12Q8CI85 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ca12Q8CI85 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ca12Q8CI85 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ca12Q8CI85 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ca12Q8CI85 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ca12Q8CI85 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ca12Q8CI85 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ca12Q8CI85 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ca12Q8CI85 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ca12Q8CI85 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ca12Q8CI85 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ca12Q8CI85 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ca12Q8CI85 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ca12Q8CI85 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ca12Q8CI85 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ca12Q8CI85 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ca12Q8CI85 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ca12Q8CI85 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ca12Q8CI85 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ca12Q8CI85 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ca12Q8CI85 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ca12Q8CI85 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ca12Q8CI85 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ca12Q8CI85 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ca12Q8CI85 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ca12Q8CI85 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ca12Q8CI85 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ca12Q8CI85 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ca12Q8CI85 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ca12Q8CI85 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ca12Q8CI85 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ca12Q8CI85 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ca12Q8CI85 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ca12Q8CI85 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ca12Q8CI85 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ca12Q8CI85 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ca12Q8CI85 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ca12Q8CI85 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ca12Q8CI85 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ca12Q8CI85 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ca12Q8CI85 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ca12Q8CI85 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ca12Q8CI85 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ca12Q8CI85 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ca12Q8CI85 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ca12Q8CI85 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ca12Q8CI85 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ca12Q8CI85 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ca12Q8CI85 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ca12Q8CI85 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ca12Q8CI85 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms