Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gpc3Q8CFZ4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gpc3Q8CFZ4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpc3Q8CFZ4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpc3Q8CFZ4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpc3Q8CFZ4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpc3Q8CFZ4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpc3Q8CFZ4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpc3Q8CFZ4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gpc3Q8CFZ4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpc3Q8CFZ4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpc3Q8CFZ4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpc3Q8CFZ4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpc3Q8CFZ4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpc3Q8CFZ4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpc3Q8CFZ4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gpc3Q8CFZ4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gpc3Q8CFZ4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms