Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nup88Q8CEC0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nup88Q8CEC0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nup88Q8CEC0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nup88Q8CEC0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nup88Q8CEC0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nup88Q8CEC0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nup88Q8CEC0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nup88Q8CEC0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nup88Q8CEC0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nup88Q8CEC0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nup88Q8CEC0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nup88Q8CEC0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nup88Q8CEC0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nup88Q8CEC0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nup88Q8CEC0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nup88Q8CEC0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nup88Q8CEC0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nup88Q8CEC0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nup88Q8CEC0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nup88Q8CEC0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Nup88Q8CEC0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nup88Q8CEC0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nup88Q8CEC0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nup88Q8CEC0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nup88Q8CEC0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Nup88Q8CEC0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nup88Q8CEC0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nup88Q8CEC0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nup88Q8CEC0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup88Q8CEC0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup88Q8CEC0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup88Q8CEC0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup88Q8CEC0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup88Q8CEC0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nup88Q8CEC0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nup88Q8CEC0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nup88Q8CEC0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup88Q8CEC0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup88Q8CEC0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup88Q8CEC0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup88Q8CEC0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup88Q8CEC0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup88Q8CEC0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup88Q8CEC0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup88Q8CEC0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup88Q8CEC0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup88Q8CEC0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup88Q8CEC0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nup88Q8CEC0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nup88Q8CEC0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nup88Q8CEC0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nup88Q8CEC0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nup88Q8CEC0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup88Q8CEC0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup88Q8CEC0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup88Q8CEC0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nup88Q8CEC0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nup88Q8CEC0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nup88Q8CEC0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nup88Q8CEC0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nup88Q8CEC0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Nup88Q8CEC0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nup88Q8CEC0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nup88Q8CEC0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nup88Q8CEC0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nup88Q8CEC0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nup88Q8CEC0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nup88Q8CEC0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nup88Q8CEC0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nup88Q8CEC0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nup88Q8CEC0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Nup88Q8CEC0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Nup88Q8CEC0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nup88Q8CEC0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nup88Q8CEC0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup88Q8CEC0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup88Q8CEC0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nup88Q8CEC0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nup88Q8CEC0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Nup88Q8CEC0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nup88Q8CEC0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nup88Q8CEC0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nup88Q8CEC0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nup88Q8CEC0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nup88Q8CEC0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nup88Q8CEC0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nup88Q8CEC0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nup88Q8CEC0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms