Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Riox2Q8CD15 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Riox2Q8CD15 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Riox2Q8CD15 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Riox2Q8CD15 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Riox2Q8CD15 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Riox2Q8CD15 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Riox2Q8CD15 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Riox2Q8CD15 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Riox2Q8CD15 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Riox2Q8CD15 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Riox2Q8CD15 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Riox2Q8CD15 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Riox2Q8CD15 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Riox2Q8CD15 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Riox2Q8CD15 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Riox2Q8CD15 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Riox2Q8CD15 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Riox2Q8CD15 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Riox2Q8CD15 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Riox2Q8CD15 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Riox2Q8CD15 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Riox2Q8CD15 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Riox2Q8CD15 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Riox2Q8CD15 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Riox2Q8CD15 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Riox2Q8CD15 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Riox2Q8CD15 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Riox2Q8CD15 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Riox2Q8CD15 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Riox2Q8CD15 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Riox2Q8CD15 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Riox2Q8CD15 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Riox2Q8CD15 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Riox2Q8CD15 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Riox2Q8CD15 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Riox2Q8CD15 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Riox2Q8CD15 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Riox2Q8CD15 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Riox2Q8CD15 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Riox2Q8CD15 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Riox2Q8CD15 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Riox2Q8CD15 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Riox2Q8CD15 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Riox2Q8CD15 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Riox2Q8CD15 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Riox2Q8CD15 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Riox2Q8CD15 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Riox2Q8CD15 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Riox2Q8CD15 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Riox2Q8CD15 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Riox2Q8CD15 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Riox2Q8CD15 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Riox2Q8CD15 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Riox2Q8CD15 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Riox2Q8CD15 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Riox2Q8CD15 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Riox2Q8CD15 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Riox2Q8CD15 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Riox2Q8CD15 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Riox2Q8CD15 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms