Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK6

Ythdf3, YTH domain-containing family protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf3Q8BYK6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ythdf3Q8BYK6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ythdf3Q8BYK6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ythdf3Q8BYK6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ythdf3Q8BYK6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ythdf3Q8BYK6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdf3Q8BYK6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ythdf3Q8BYK6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ythdf3Q8BYK6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms